ДНК-штрихкодирование гидробионтов Азово-Черноморского рыбохозяйственного бассейна
В 2025 году сотрудники лаборатории генетических исследований Южного филиала ГНЦ РФ ФГБНУ «ВНИРО» в рамках прикладной работы по ДНК-штрихкодированию основных промысловых видов водных биоресурсов и прилова провели актуализацию информации по образцам гидробионтов Азово-Черноморского рыбохозяйственного бассейна в международной базе «BOLD SYSTEMS», посвященной ДНК-баркодированию. Специалисты обработали 66 образцов рыб, представляющих 18 родов, и 9 образцов беспозвоночных, относящихся к 4 родам.
Для обеспечения систематизации и уникальной идентификации образцов в базе данных, каждому каталожному образцу базы данных Южного филиала ВНИРО было присвоено уникальное наименование в соответствии с внутренней схемой номенклатуры. После обработки данных и загрузки их в систему, каждый образец теперь содержит нуклеотидную последовательность (FASTA), при возможности аминокислотный перевод, графическое представление баркода, трассовые файлы с электрофореграммами и показатели качества считывания. Кроме того, запись также включает информацию о праймерах, аннотации, комментарии и публикационные данные, что обеспечивает полную трассируемость, стандартизацию и воспроизводимость.
Работа по пополнению международной базы новыми образцами будет продолжена, что позволит расширять таксономический охват и увеличивать объем данных секвенирования. Эта работа создаст надежный фундамент для долгосрочного мониторинга биоразнообразия, совершенствования методов видовой идентификации и интеграции региональной науки в международное пространство.
Пресс-служба Южного филиала ГНЦ РФ ФГБНУ «ВНИРО»