Важнейшим элементом охраны водных биологических ресурсов является оснащение водозаборов промышленных и сельскохозяйственных предприятий сооружениями рыбозащиты.
Хорошо известно, что в XX веке в Черном море появился хищный брюхоногий моллюск рапана, исходно обитающий в акватории Японского моря в широком диапазоне солености – от 32 до 15 ‰. К концу 60-х годов прошлого века этот моллюск распространился по всей акватории Черного моря и с 1970-х годов его стали активно добывать во всех причерноморских странах.
Согласно плановой научной работы по Государственному заданию на 2016 год сотрудники лаборатории естественного воспроизводства рыб и лаборатории аналитического контроля водных экосистем ФГБНУ «АзНИИРХ» на катере Т-63 М с 23 по 30 сентября провели экспедицию по р. Дон. Маршрут проходил от г. Семикаракорск до Донского запретного пространства.
7 сентября 2016 г. во исполнение «Плана мероприятий по усилению государственного контроля за соблюдением законодательства РФ в области рыболовства и сохранения водных биологических ресурсов на Веселовском, Пролетарском и Усть-Манычском водохранилищах на сентябрь 2016 года» должностными лицами Нижнедонского отдела рыбоохраны АЧТУ Росрыболовства совместно с сотрудником Веселовского поста государственного мониторинга ФГБНУ «АзНИИРХ» был проведен рейд по пресечению незаконной добычи (вылова) водных биоресурсов в Веселовском водохранилище.
В третьем квартале 2016 г., в соответствии с Планом ресурсных исследований сотрудниками лаборатории промыслового прогнозирования Краснодарского отделения ФГБНУ «АзНИИРХ» в Азовских лиманах, имеющих воспроизводственное и промысловое значение, проведены исследования по оценке распределения, численности и воспроизводства водных биоресурсов. Были обследованы все группы лиманов: Куликово-Курчанская, Черноерковско-Сладковская, Ахтарско-Гривенская, Челбасская, а также в лиманы Большой Ахтанизовский и Курчанский.
Обращаем внимание всех пользователей водными биоресурсами Азово-Черноморского рыбохозяйственного бассейна, что в соответствии с приказом Азово-Черноморского территориального управления Росрыболовства от 15.09.2016 № 629 объявлено завершение заморного периода в Азовском море и Таганрогском заливе с 15.09.2016 года.
По данным мониторинговых наблюдений ФГБНУ «АзНИИРХ» в 2016 г., как и в предыдущие годы, миграция черноморско-азовской проходной сельди через Керченский пролив в Азовское море началась ранней весной, в середине марта, при температуре воды 3-5 0С.
В период с 23 августа по 15 сентября сотрудниками ФГБНУ «АзНИИРХ» и ФГБНУ «ЮгНИРО» в Черном море на ПТР «Денеб» проведены учётно-траловая съёмка по учёту запасов и оценке эффективности размножения морских рыб и комплексная океанографическая съёмка российских территориальных вод и исключительной экономической зоны России в Керченском предпроливье.
5-8 сентября 2016 г. в г. Ростове-на-Дону состоялась Международная научная конференция «Окружающая среда и человек», посвященная памяти члена-корреспондента РАН Д.Г. Матишова. В конференции приняли участие директор ФГБНУ «АзНИИРХ», к.э.н. Н.В. Господарев и сотрудники института.
С 5 по 20 августа 2016 г. ФГБНУ «АзНИИРХ» совместно с сотрудниками ФГБНУ «ЮгНИРО» выполнялся рейс по изучению состояния запасов пелагических рыб и оценка среды обитания ВБР на акватории Азовского моря.